九二一地震的殺傷力，反映在房屋上最慘烈，截止十二月底止，南投
縣鑑定全倒房屋有二八四六四戶，半倒二九二七一戶，有爭議待鑑定數三三０戶，合計五八０六五戶，占全縣房屋一半左右，其餘未列全倒半倒的
，也都有不同成程度的震災損失。
二萬餘戶房屋全倒，有的夷為平地，有的四樓變二樓，有的傾斜，有的後仰，有的高樓下沉，倒狀及倒樓之慘，多不盛舉；強震下，土埆厝固然不保，連棟店面不乏整排下陷一樓，許多大樓及集合在住宅公寓，也站不穩，挺不住。
所有倒屋都是災民畢生心血的累積，數十年努力的成果，在一夕之間化為烏有，災民又如何能不悲；尤其許多人奮鬥數十年，都臨老待退，青春不在，又如何能夠重頭來過！
財產一夕蕩然，尚可看開看淡，斷垣殘壁中卻壓著八百多位災民，家破人亡之慟，卻是椎心泣血。
倒屋數量以埔里一萬二千餘戶最多，南投市一萬一千餘戶居次，竹山六千餘戶；比例最高的則是接近震央的中寮鄉，中寮鄉死亡一七九人，占全鄉人口數的百分之一，如果以實際居住人口估算，則可能超過百分之二
。
南投市國泰人壽大樓在主震後便橫在南投室三和三路上，名間鄉上毅大樓則倒於九月二十六日上午的六．八跟規模餘震，怵目驚心；中寮鄉鄉親寮永平街所有木造房屋全倒在街上，途為斷木破瓦所塞，還造成四十人傷亡，境況悽慘。
埔里鎮倒屋四處，大埔里有線電視新完成的五樓建物也應聲而倒；中
華商場ˋ大批連棟商街及多棟集合大樓也都陷於地震後。
竹山鎮玉山新城本是明潭水庫興建時，迫遷居民安身立命之所，五十二戶全倒之下，奪走了四十條人命，是全南投縣死亡人數密集的三大災區之一。及山路一棟才完成結構的十層雙星市大樓後仰傾斜，變成地標。
草屯鎮以山腳里災區最嚴重；國姓舊街幾乎全毀；集集鬧區一夕成廢墟；魚池觀光損失最重；鹿谷倒屋在清水ˋ秀峰ˋ瑞田最多；名間集中在萬丹一帶；水里情形較輕微。
兩個山地鄉倒屋及死亡數都遠低於平地鄉鎮，唯仁愛鄉的互助村中原ˋ發祥村瑞岩ˋ信義鄉潭南村等部落，都受山崩土石滅村的威脅，專家認為有遷村的必要。
潭南村算是其中比較嚴重的，村落半毀，災民長期住在簡陋的雨蓬或
鐵皮屋裡，生活品質極差，即使如此，多數潭南村民還是不願意遷村。